La Boquera se considera uno de los enclaves de mayor interés faunístico del Parque Cultural del Río Vero y un paraíso para los amantes de la ornitología.
Aquí confluyen tres tipos de ecosistemas: las aguas del Vero y Cinca, los sotos ribereños y los escarpes de yeso, en una zona declarada L.I.C. ( Lugar de Interés Comunitario).
En torno al río habita un gran número de aves: martín pescador, pájaro moscón, mitos, oropéndolas, carboneros, lavanderas, garzas reales, pájaros carpinteros o cigüeñas blancas.
Entre los peces destacan las madrillas, barbos, carpas, truchas, lucios, peces lobo y peces fraile.
Los escarpes de yeso son lugares idóneos para la nidificación del abejaruco, cernícalo común, vencejo real o avión común, entre otros.